I tillegg til akkrediteringar og evaluering av kvalitetssikringssystema i høgre utdanningsinstitusjonar, kan NOKUT etter lova ta initiativet til andre typar evaluering for å bedømme kvaliteten på utvalde område. Departementet kan også pålegge NOKUT å gjennomføre slike evalueringar, og frå 2004 har NOKUT fått i oppdrag å gjennomføre i alt tre programevalueringar.
Evaluering av førskulelærarutdanning som starta opp i 2008, vil bli avslutta i september 2010.
Avslutta evalueringar:
Evaluering av treårige ingeniørutdanningar som følgjer rammeplanen starta opp i 2006, og blei avslutta i september 2008.
I 2004 fekk NOKUT i oppgåve å evaluere allmennlærarutdanningane. Denne evalueringa blei avslutta i september 2006.